Resumen
12.000 años después de los acontecimientos de Sousei no Aquarion, la humanidad se ve amenazada por un nuevo enemigo de otra dimensión denominado “Abductores”, quienes al igual que los Ángeles de las Sombras, invaden las ciudades humanas para secuestrar a sus habitantes. Para defender a la humanidad de esta invasión, la organización Neo-DEAVA establece dos equipos, uno compuesto únicamente por hombres y otro únicamente por mujeres, cada uno pilotando sus propias máquinas gigantes llamadas “Aquaria”. Para proteger a su nuevo amigo Mikono, el adolescente Amata Sora decidió usar los poderes que ha mantenido en secreto toda su vida y, al combinar Vectors con pilotos masculinos y femeninos en un solo robot, el legendario gigante Aquarion renace una vez más.