De Wikipedia: Ambientada en la era moderna, la historia trata sobre Miharu Rokujou, que sólo quería vivir una vida normal y heredar un restaurante Okonomiyaki. Por el momento, su mayor problema eran las constantes molestias de Kouichi Aizawa y Durandal Thobari Kumohira, quienes iniciaron un club Nindō (忍道?, iluminado. "El Camino del Ninja"). Miharu no quería tener nada que ver con los "ninjas" y siempre los rechaza. Pero pronto, es atacado por un grupo real de ninjas y está protegido por Kouichi y Kumohira. Allí, Miharu aprende sobre el mundo ninja oculto Nabari, los roles de su compañero de clase y maestro en ese mundo, y del arte secreto Shinra Banshou (森羅万象 Shinrabanshō?, iluminado. "todas las cosas en la naturaleza") dentro de él. El arte secreto, que contiene todo el conocimiento del mundo, es muy codiciado en Nabari. Y por eso, Miharu no puede volver a su vida normal. Debe convertirse en el "Gobernante de Nabari" para sobrevivir. De Baka-Updates: Rokujou Miharu era un estudiante de secundaria aparentemente reacio que vivía en su propio mundo. Sin embargo, dentro de él, acechaba el poder supremo de Nabari, "Omnipotente". Para poseer tal arma suprema, la manada de lobos de Iga juró traer a Miharu de regreso a la aldea de Iga. Por otro lado, la profesora de inglés de Miharu, Kumohira sensei, y su compañero de clase, Kouichi, eran los ninjas Banten cuya misión era proteger a Miharu. Comenzó así una guerra por la propiedad de “Omnipotente”. Para sobrevivir, Miharu debe ingresar al mundo oculto de Nabari para convertirse en rey.
