El mundo está en un estado de aislamiento. La causa se debe a las misteriosas entidades de las profundidades marinas que la armada ha denominado la "Flota de las profundidades marinas" y que se apoderan de los mares aislando a todos los países del mundo entre sí. Negándose a quedarse de brazos cruzados y dejar que la Flota del Mar Profundo se salga con la suya, todos los países del mundo unen sus recursos para fabricar una nueva arma para combatirlos ... un arma que es comparable en poder a la de un acorazado ... y su nombre es: The Fleet Girls. ¿Esta nueva arma será suficiente para combatir a la flota del mar profundo? ¿Podrá el alférez que acaba de ser enviado a la base naval donde se mantienen las "Chicas de la Flota" ayudar en su lucha ... Sólo el tiempo lo dirá cuando esta guerra contra la Flota del Mar Profundo comience a desarrollarse?
